Bono garanterer, at det websted, hvor du kan afgive en ordre, er helt sikkert. Ved at bruge en SSL-forbindelse sendes alle data via en krypteret forbindelse mellem serveren og den besøgende via en krypteret forbindelse. En SSL-forbindelse kan let genkendes ved hjælp af url'en (https://www.bono.dk).

Desuden kontrolleres Bonos websted to gange om året for sårbarheder af virksomheden Forus-P. Dette sker med henblik på certificering af Thuiswinkel.org.

Bono bruger også Shopify. Shopify er en virksomhed, der fokuserer på en sikker og nem måde at administrere en webshop på. Der arbejder over 1000+ softwareudviklere hos Shopify, som dagligt kontrollerer softwaren for sårbarheder. Det gør brugen af Bonos websted endnu mere sikker.